Giám quân Lý Bí đưa ba mươi chiến thuyền cùng một ngàn binh tướng xuống ngã ba Hạc Trì, cho chia đội chiến thuyền đóng thành ba trại khống chế các dòng chảy chính ở ngã ba sông. Cùng đó, quân sư Tinh Thiều và hơn trăm khinh thuyền chở lương thảo, vật dụng, khí cụ từ Đầm Bạch Long xuống thủy trại Hạc Trì.
Khi lũ em dạn dĩ với cảnh nhà quê nơi sơ tán thì Núi cũng có một tình yêu. Người yêu của Núi là Hiền – cô giáo dạy mầm non trường làng. Núi quen Hiền...
Sau năm năm sống yên ổn, sang đầu năm 1966, thành phố có lệnh sơ tán khẩn cấp. Gia đình Núi được sẻ làm ba. Anh Ý về ở với cậu em út của mẹ cả bên Thủy...
Tiểu thuyết “ Sóng ở đáy sông” mở ra với nhân vật Núi, một ông chủ nghề mộc đã được mãn hạn tù. 33 người làm của của Núi hoặc đang ở tù, hoặc sắp hết hạn,...