Ông Thỉnh bỗng thấy áy náy chuyện bấy lâu nay không quan tâm tới mẹ con Thành, đứa em gái không được may mắn vì phải nghe theo lời bố và anh trai. Qua nhà Thành, ông sửa sang lại mái nhà cho mẹ con cô, cắt đặt vườn tược cho ngăn nắp…một phần an ủi đứa em gái mà ông dường như bỏ quên. Sau nhiều ngày suy nghĩ Thuỳ quyết định lên phòng giáo dục để nộp đơn xin đi học trung cấp sư phạm. Vì là con liệt sĩ lại tha thiết được đi học nên Thuỳ nhận được thiện cảm và sự ủng hộ của ông trưởng phòng....
Khi lũ em dạn dĩ với cảnh nhà quê nơi sơ tán thì Núi cũng có một tình yêu. Người yêu của Núi là Hiền – cô giáo dạy mầm non trường làng. Núi quen Hiền...
Sau năm năm sống yên ổn, sang đầu năm 1966, thành phố có lệnh sơ tán khẩn cấp. Gia đình Núi được sẻ làm ba. Anh Ý về ở với cậu em út của mẹ cả bên Thủy...
Tiểu thuyết “ Sóng ở đáy sông” mở ra với nhân vật Núi, một ông chủ nghề mộc đã được mãn hạn tù. 33 người làm của của Núi hoặc đang ở tù, hoặc sắp hết hạn,...