Một đơn vị lính đặc công của ta nhận nhiệm vụ xuống vùng ven sông Sài Gòn để trinh sát, nghiên cứu địa bàn. Đoàn chiến sĩ đang ngày đêm vượt rừng tiến về Sài Gòn trong tiếng máy bay ầm ù , tiếng B52 dội ác liệt. Đường đi mỗi ngày càng nguy hiểm, lương thực thiếu thốn, bộ đội ta phải ăn rau tàu bay, ăn gạo mốc . Linh - người chiến sĩ quả cảm cùng đồng đội mình vượt đường rừng liệu có thoát trận bố rác của giặc trên đường hành quân tiến về phía trước hay không.
Khi lũ em dạn dĩ với cảnh nhà quê nơi sơ tán thì Núi cũng có một tình yêu. Người yêu của Núi là Hiền – cô giáo dạy mầm non trường làng. Núi quen Hiền...
Sau năm năm sống yên ổn, sang đầu năm 1966, thành phố có lệnh sơ tán khẩn cấp. Gia đình Núi được sẻ làm ba. Anh Ý về ở với cậu em út của mẹ cả bên Thủy...
Tiểu thuyết “ Sóng ở đáy sông” mở ra với nhân vật Núi, một ông chủ nghề mộc đã được mãn hạn tù. 33 người làm của của Núi hoặc đang ở tù, hoặc sắp hết hạn,...