Hàn Thành Tố – một chủ đồn điền người Hoa chạy giặc Mãn sang cát cứ bàn với chủ đồn điền Tống Khang phá việc làm ăn của Tổng Ngũ. Biết không thể phá trực diện được nên bọn chúng tìm cách cấu kết với Quân “toe”. Chúng nghĩ mưu kế hãm hại Tổng Ngũ bằng cách giết hại một số cán bộ Việt Minh khiến tất cả mọi nghi ngờ dồn vào Tổng Ngũ, khiến ông phải xin nghỉ công tác và từ bỏ nơi gia đình ông đã gắn bó năm đời, lên Tổng Kim nương nhờ ông vãi.
Khi lũ em dạn dĩ với cảnh nhà quê nơi sơ tán thì Núi cũng có một tình yêu. Người yêu của Núi là Hiền – cô giáo dạy mầm non trường làng. Núi quen Hiền...
Sau năm năm sống yên ổn, sang đầu năm 1966, thành phố có lệnh sơ tán khẩn cấp. Gia đình Núi được sẻ làm ba. Anh Ý về ở với cậu em út của mẹ cả bên Thủy...
Tiểu thuyết “ Sóng ở đáy sông” mở ra với nhân vật Núi, một ông chủ nghề mộc đã được mãn hạn tù. 33 người làm của của Núi hoặc đang ở tù, hoặc sắp hết hạn,...