Lời kể của chị Hai Thanh trong đêm thứ hai bắt đầu về cái chết thảm khốc của Riềng. Biết Riềng là em trai chị nên bọn địch luôn để ý, theo dõi anh từng bước. Một ngày tên quận trưởng đánh xe jeep đến tận nhà đe dọa anh phải dừng lại toàn bộ những việc làm chống lại, tổn hại đến chúng nếu không sẽ phải trả giá. Vẻ ác ôn của tên quận trưởng không làm Riềng náo núng tinh thần, anh vẫn bình thản tiếp đón bọn chúng như không có chuyện gì xảy ra.
Khi lũ em dạn dĩ với cảnh nhà quê nơi sơ tán thì Núi cũng có một tình yêu. Người yêu của Núi là Hiền – cô giáo dạy mầm non trường làng. Núi quen Hiền...
Sau năm năm sống yên ổn, sang đầu năm 1966, thành phố có lệnh sơ tán khẩn cấp. Gia đình Núi được sẻ làm ba. Anh Ý về ở với cậu em út của mẹ cả bên Thủy...
Tiểu thuyết “ Sóng ở đáy sông” mở ra với nhân vật Núi, một ông chủ nghề mộc đã được mãn hạn tù. 33 người làm của của Núi hoặc đang ở tù, hoặc sắp hết hạn,...