Từ sư phụ sau gần một năm vào rừng Hắc Lâm có việc trọng đại với sư huynh Đỗ Khuông đã trở về Hương Cổ Pháp. Trong thời gian Từ sư phụ đi vắng, tiểu tăng Tinh Thiều luôn miệt mài tu tập, noi gương Thầy trông nom việc chùa chu toàn. Lý hương trưởng biết ăn ở lễ nghĩa, yêu thương dân, chỉ dạy dân chúng việc cấy cầy, săn bắn xây dựng cuộc sống ấm no; noi gương truyền thống dòng họ, một lòng hướng về phật pháp.
Khi lũ em dạn dĩ với cảnh nhà quê nơi sơ tán thì Núi cũng có một tình yêu. Người yêu của Núi là Hiền – cô giáo dạy mầm non trường làng. Núi quen Hiền...
Sau năm năm sống yên ổn, sang đầu năm 1966, thành phố có lệnh sơ tán khẩn cấp. Gia đình Núi được sẻ làm ba. Anh Ý về ở với cậu em út của mẹ cả bên Thủy...
Tiểu thuyết “ Sóng ở đáy sông” mở ra với nhân vật Núi, một ông chủ nghề mộc đã được mãn hạn tù. 33 người làm của của Núi hoặc đang ở tù, hoặc sắp hết hạn,...