Sau khi cứu được thằng Hùng khỏi tay kẻ thù, vợ của binh trạm trưởng Lan đã đưa con trai đi tìm bố. Binh trạm trưởng bất ngờ và hạnh phúc khi được gặp vợ và con trai tại chiến trường. Nhưng ông rất đau lòng khi nhận ra thằng Hùng đã bị kẻ thù nhồi nhét vào đầu những tư tưởng đối địch với cộng sản và quân giải phóng.
Khi lũ em dạn dĩ với cảnh nhà quê nơi sơ tán thì Núi cũng có một tình yêu. Người yêu của Núi là Hiền – cô giáo dạy mầm non trường làng. Núi quen Hiền...
Sau năm năm sống yên ổn, sang đầu năm 1966, thành phố có lệnh sơ tán khẩn cấp. Gia đình Núi được sẻ làm ba. Anh Ý về ở với cậu em út của mẹ cả bên Thủy...
Tiểu thuyết “ Sóng ở đáy sông” mở ra với nhân vật Núi, một ông chủ nghề mộc đã được mãn hạn tù. 33 người làm của của Núi hoặc đang ở tù, hoặc sắp hết hạn,...